Nuklease memainkan peran yang sangat diperlukan dalam teknologi DNA rekombinan, genetika, dan rekayasa genetika. Karena kemampuannya untuk memotong segmen DNA, nuklease memiliki berbagai aplikasi praktis. Endonuklease dan eksonuklease adalah dua jenis nuklease. Meskipun bingung karena artinya sama, endonuklease dan eksonuklease memiliki karakteristik yang berbeda untuk membuktikan bahwa keduanya berbeda.
Endonuklease vs Eksonuklease
Perbedaan antara endonuklease dan eksonuklease adalah bahwa endonuklease adalah sekelompok enzim yang memotong segmen DNA dari sisi dalam. Di sisi lain, enzim eksonuklease memotong segmen DNA dari ujungnya. Selain itu, enzim endonuklease memiliki ujung yang lengket atau tumpul. Sebaliknya, enzim eksonuklease memiliki ujung yang lengket.
Endonuklease mengacu pada kelompok enzim yang ditemukan dalam rantai polinukleotida yang memotong ikatan fosfodiester. Endonuklease restriksi adalah salah satu jenis endonuklease yang paling umum. Fungsinya untuk memotong segmen DNA pada tempat pengenalannya. Lebih penting lagi, enzim endonuklease memotong segmen DNA dari sisi dalam.
Eksonuklease mengacu pada kelompok enzim yang berfungsi dengan memotong nukleotida satu per satu dari Exo (ujung) rantai polinukleotida. Ini memiliki potensi untuk memotong DNA dan RNA. Aplikasi exonuclease yang paling penting adalah untuk membantu dalam perbaikan DNA. Lebih penting lagi, enzim eksonuklease memotong segmen DNA dari ujungnya.
Tabel Perbandingan Antara Endonuklease dan Eksonuklease
| Parameter Perbandingan | endonuklease | eksonuklease |
| Definisi | Endonuklease mengacu pada kelompok enzim yang memotong segmen DNA dari sisi dalam. | Exonuclease mengacu pada kelompok enzim yang memotong segmen DNA dari ujungnya. |
| Periode Jeda | Endonuklease, seperti endonuklease restriksi, mengalami periode jeda sebelum melakukan tugas spesifiknya. | Dalam eksonuklease, tidak ada periode jeda sebelum dimulainya tugas khusus mereka. |
| Hasil Dalam | Pembelahan segmen DNA menghasilkan oligonukleotida. | Pembelahan segmen DNA menghasilkan nukleosida. |
| Fungsi | Enzim endonuklease berperan dalam pertahanan karena mereka mencegah masuknya patogen. | Eksonuklease tidak memiliki fungsi pertahanan. |
| Gratis Berakhir | Enzim endonuklease tidak memerlukan ujung 3' dan 5' bebas untuk menjalankan fungsinya. | Eksonuklease membutuhkan ujung bebas untuk memulai tugas spesifik mereka. |
Apa itu Endonuklease?
Endonuklease mengacu pada kelompok enzim yang ditemukan dalam rantai polinukleotida yang memotong ikatan fosfodiester. Beberapa enzim endonuklease, misalnya, deoksiribonuklease I, memotong asam Deoksiribonukleat tanpa memperhatikan urutannya. Di sisi lain, sebagian besar enzim endonuklease membelah pada urutan nukleotida yang sangat spesifik. Selain itu, mereka juga disebut enzim restriksi.
Salah satu kelompok endonuklease yang paling vital adalah enzim restriksi. Enzim restriksi memiliki tiga kategori berdasarkan mekanisme kerjanya: Tipe I, Tipe II, dan Tipe III. Salah satu aplikasi praktis dari enzim ini adalah dalam rekayasa genetika. Selain itu, endonuklease restriksi berjumlah ratusan dan masing-masing bertanggung jawab menyerang situs tertentu.
Sel bakteri adalah sumber alami dari endonuklease restriksi. Selain itu, ujung endonuklease tumpul atau lengket. Contoh endonuklease yang terkenal adalah Cas9. Contoh lain dari endonuklease adalah BamHI, Deoxyribonuclease I, dan EcoRI.
Endonuklease sangat penting karena beberapa alasan. Namun, salah satu alasan yang lebih menonjol adalah kemampuannya untuk memperbaiki sel DNA yang rusak secara tepat. Ini, pada gilirannya, membantu menghindari kerusakan lebih lanjut pada enzim lain. Terlepas dari ini, beberapa enzim endonuklease berfungsi defensif. Dengan demikian, mereka mencegah masuknya beberapa patogen.
Apa itu Eksonuklease?
Eksonuklease mengacu pada kelompok enzim yang berfungsi dengan memotong nukleotida satu per satu dari Exo (ujung) rantai polinukleotida. Enzim ini memotong nukleotida baik dari 3 'atau 5' pada satu waktu tertentu. Selain itu, eksonuklease berfungsi sebagai enzim hidrolisis. Mereka terdiri dari satu set besar enzim yang dicirikan secara biokimia dan struktural yang memiliki karakteristik yang bervariasi.
Pengetahuan yang luas tentang enzim endonuklease adalah hasil dari karakterisasi terstruktur dari bakteri E. coli. Dalam satu sel E. coli, terdapat lebih dari 20 aktivitas eksonuklease yang bervariasi. Exonuclease ditemukan pada manusia, bakteri, hewan, dan serangga. Menariknya, racun kadal dan ular terdiri dari enzim eksonuklease.
Enzim eksonuklease memainkan peran penting dalam metabolisme dan pemeliharaan sel. Selain itu, mereka adalah aspek penting dari stabilitas genom karena mereka memotong DNA dari ujung bebas. Eksonuklease mungkin juga berperan dalam memperbaiki sel DNA yang rusak. Namun, mereka tidak memiliki fungsi pertahanan. Akibatnya, eksonuklease mungkin tidak efisien untuk perlindungan terhadap patogen.
Eksonuklease biasanya kurang memperhatikan urutan. Jadi, mereka adalah enzim non-spesifik. Beberapa contoh enzim eksonuklease adalah racun kadal dan Exonuclease I. Dalam kasus enzim eksonuklease, periode jeda tidak ada sebelum aktivitas. Secara meyakinkan, eksonuklease adalah sekelompok enzim yang melayani fungsi multi-segi.
Perbedaan Utama Antara Endonuklease dan Eksonuklease
Kesimpulan
Dengan demikian, definisi, periode jeda, pembelahan, ujung, dan spesifisitas endonuklease dan eksonuklease membuktikan bahwa keduanya berbeda. Enzim endonuklease adalah urutan-spesifik. Akibatnya, mereka memulai pekerjaan mereka hanya ketika mereka menemukan situs pengenalan yang tepat. Eksonuklease, di sisi lain, bekerja secara acak. Dengan demikian, mereka tidak memiliki perhatian khusus untuk urutan.
Fungsi utama endonuklease adalah untuk melarang masuknya beberapa patogen. Namun, enzim eksonuklease tidak berperan dalam pertahanan. Meskipun demikian, mereka memainkan peran penting dalam metabolisme dan pemeliharaan sel. Kesimpulannya, baik endonuklease dan eksonuklease memiliki fungsi, karakteristik, dan sifat yang spesifik.
