Bagian terdalam dari laut atau samudra tidak mendapatkan fasilitas sinar matahari bahkan di siang hari. Organisme yang berada di bagian terdalam dari laut atau samudra memiliki kelebihan cahaya di dalam tubuhnya secara alami. Karakteristik pada hewan ini disebut bioluminescence. Ini membantu mereka untuk memangsa dan terkadang juga bersembunyi dari pemangsa. Beberapa juga menggunakan ini karena kami menggunakan obor. Bahan kimia yang membantu menciptakan pendaran ini berbeda di setiap organisme. Aequorea victoria adalah ubur-ubur yang memiliki GFP untuk bioluminesensi. Untuk mengetahui lebih lanjut tentang protein ini, berikut adalah beberapa perbedaan antara GFP dan YFP.
GFP vs YFP
Perbedaan antara GFP dan YFP adalah bahwa GFP adalah protein utama yang diproduksi dalam ubur-ubur, dan YFP adalah versi mutasi dari YFP. GFP adalah Protein Fluoresen Hijau, dan YFP adalah Protein Fluoresen Kuning. Mereka juga berbeda dalam warna, satu berwarna hijau, dan yang lainnya berwarna kuning. Protein Fluoresen Kuning memiliki puncak emisi dan eksitasi yang lebih tinggi dibandingkan dengan puncak emisi dan eksitasi dari Protein Fluoresen Hijau.
Bentuk lengkap GFP adalah Green Fluorescent Protein. Hal ini ditemukan dalam ubur-ubur yang dikenal sebagai Aequorea Victoria. Karakteristik utama GFP adalah memancarkan fluorescent hijau saat terkena sinar ultraviolet yang kabur. Protein ini terdiri dari 238 asam amino. Ini juga memiliki beberapa versi yang ditingkatkan, yang terutama digunakan untuk eksperimen. Ini digunakan untuk memproduksi gen baru dalam sel dan bidang biologi molekuler.
Bentuk lengkap dari YFP adalah Yellow Fluorescent Protein. Ini adalah versi yang diredam dari Green Fluorescent Protein yang ditemukan di Aequorea Victoria. Protein ini memancarkan fluoresensi kuning ketika terkena sinar UV biru. Ini memiliki tiga versi yang ditingkatkan. Mereka adalah Ypet, Citrine, dan Venus. Protein ini juga digunakan untuk eksperimen dalam sel dan biologi molekuler.
Tabel Perbandingan Antara GFP dan YFP
| Parameter Perbandingan | GFP | YFP |
| Wujud sempurna | Protein Neon Hijau | Protein Fluoresen Kuning |
| Berasal dari | Aequorea Victoria yang merupakan jenis ubur-ubur | Mutan genetik Green Fluorescent Protein |
| Puncak eksitasi (panjang gelombang) | 395 nm | 515 nm |
| Puncak emisi (panjang gelombang) | 509 nm | 527 nm |
| Versi yang ditingkatkan | smRS-GFP | Yapet, Citrine, Venus |
Apa itu GFP?
Bentuk lengkap GFP adalah Green Fluorescent Protein. Hal ini ditemukan dalam ubur-ubur yang dikenal sebagai Aequorea Victoria. Karakteristik utama GFP adalah memancarkan fluorescent hijau saat terkena sinar ultraviolet yang kabur. Protein ini terdiri dari 238 asam amino. Massa molekulnya adalah 27kD. Ini juga memiliki beberapa versi yang ditingkatkan, yang terutama digunakan untuk eksperimen.
Protein ini memiliki panjang gelombang fluoresensi tipe emisi dan tipe eksitasi. Puncak emisi adalah rentang di mana sinar dipancarkan, dan puncak eksitasi adalah ketika foton tereksitasi dan mulai memancarkan cahaya. Puncak eksitasi adalah 395nm, dan puncak emisi adalah 515nm.
GFP memiliki aplikasi utama dalam penelitian sel dan molekuler. Protein ini digunakan sebagai gen reporter oleh para ilmuwan dalam sel dan molekuler. Gen reporter adalah jenis gen yang melekat pada gen lain yang digunakan untuk percobaan secara berurutan dan mudah diidentifikasi sehubungan dengan gen utama. Ini digunakan sebagai gen reporter karena karakteristik bioluminesensinya.
Protein ini memiliki banyak keunggulan lain juga. Gen ini turun temurun, dan juga tidak bereaksi dengan gen lain secara biologis. Jadi untuk penelitian, gen ini paling disukai.
Apa itu YFP?
Bentuk lengkap dari YFP adalah Yellow Fluorescent Protein. Ini adalah versi yang diredam dari Green Fluorescent Protein yang ditemukan di Aequorea Victoria. Protein ini memancarkan fluoresensi kuning ketika terkena sinar UV biru. Ini memiliki tiga versi yang ditingkatkan. Mereka adalah Ypet, Citrine, dan Venus. Protein ini juga digunakan untuk eksperimen dalam mikrobiologi.
Yellow Fluorescent Protein terbentuk setelah empat mutasi dari varietas liar Green Fluorescent Protein yang ditemukan di ubur-ubur laut dalam yang dikenal sebagai Aequorea Victoria. Perubahan utama dan terpenting dari mutasi adalah penggantian treonin dengan bahan kimia lain yang disebut tirosin pada posisi 203. Perubahan ini melahirkan varian YFP. Puncak eksitasi YFP adalah 515nm, dan puncak emisi adalah 527 nm. Kedua puncak lebih tinggi sehubungan dengan GFP induk.
Versi YFP yang ditingkatkan yaitu Ypet, Citrine, dan Venus memiliki beberapa keunggulan lebih dari protein induknya. Yaitu bahwa varian yang ditingkatkan ini memiliki pematangan yang lebih cepat, peningkatan pendaran, dan sensitivitas yang berkurang terhadap klorida sehubungan dengan YFP induk. YFP juga digunakan di bidang sel dan biologi molekuler. YFP terutama digunakan sebagai akseptor untuk gen sensor yang dikodekan secara genetik. Varian Venus memiliki perubahan dalam urutan asam amino baru.
Perbedaan Utama Antara GFP dan YFP
Kesimpulan
Protein ini terutama ditemukan pada hewan air yang berada jauh di bawah lautan. Ini sangat penting untuk kelangsungan hidup mereka. GFP dan YFP hanyalah contoh bahan kimia yang ditemukan dalam ubur-ubur yang disebut Aequorea Victoria. Ada jumlah tak terbatas bahan kimia dari jenis ini ditemukan dalam organisme yang berbeda sesuai dengan kebutuhan mereka untuk bertahan hidup.
Saat ini, gen dalam protein mereka digunakan untuk penelitian dan menyebabkan lahirnya banyak gen baru dari kombinasi permutasi dengan gen lain. Beberapa di antaranya memiliki keunggulan berbeda yang mengarah pada penggunaannya di area yang diperlukan.
